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HISAT-3N
3-뉴클레오타이드 변환 기반 알고리즘을 통해 비스울파이트 및 다양한 염기 치환 시퀀싱 데이터를 정밀하게 정렬하며, 에피제네틱 변형 분석에 최적화된 고속 정렬 도구.
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Bismark
비스울파이트 처리된 시퀀싱 데이터를 기준 유전체에 정렬하고, 시토신 메틸화 상태를 정확히 판별하여 CpG, CHG, CHH 컨텍스트에서 메틸화 패턴을 분석하는 고정밀 메틸화 분석 도구.
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