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Trimmomatic
Illumina NGS 데이터를 대상으로 품질 점수 기반 트리밍, 어댑터 제거, 길이 필터링 등을 지원하며, 다양한 분석 파이프라인에 활용되는 유연하고 강력한 전처리 도구.
카테고리
Quality Control
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Raw Data QC
버전
TrimGalore
Cutadapt과 FastQC를 기반으로 시퀀싱 리드에서 어댑터 서열 제거와 품질 기반 트리밍을 자동 수행하여 전처리 품질을 표준화하는 NGS 전처리 통합 도구.
카테고리
Quality Control
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Raw Data QC
버전
Sickle
Next-Generation Sequencing 데이터에서 품질 점수가 낮은 염기를 기반으로 리드를 트리밍하여 후속 분석의 정확도를 높이는 데 활용되는 간단하고 빠른 전처리 도구.
카테고리
Quality Control
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Raw Data QC
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FASTX-Toolkit
NGS 시퀀싱 결과로 생성된 FASTA 및 FASTQ 형식의 리드 데이터를 대상으로 필터링, 트리밍, 변환 등 다양한 전처리 작업을 명령줄 기반으로 수행하는 도구 모음.
카테고리
Quality Control
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Raw Data QC
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FastQC
시퀀싱된 NGS 데이터의 전체 품질을 종합적으로 평가하며, 염기별 품질, GC 함량, 중복도, 어댑터 오염 등 다양한 품질 지표를 시각적으로 제공하는 품질 관리 도구.
카테고리
Quality Control
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Raw Data QC
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fastp
시퀀싱된 FASTQ 데이터를 대상으로 어댑터 제거, 트리밍, 필터링, 오류 수정, 품질 통계 생성 등 다양한 전처리 작업을 고속으로 수행하는 통합형 품질 관리 도구.
카테고리
Quality Control
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Raw Data QC
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